聚类分析下载

　　聚类分析软件(Version1.2)是一款简单实用的聚类数据分析软件，通过该软件，用户可以进行相应的实验数据分析，软件提供了多种数据计算方式，拥有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、进行聚类计算等，您可以根据实验数据的类型进行选择；该软件主要用于计算杂合度、多态信息含量、遗传距离以及聚类分析，适用于血型、蛋白质多态、品种聚类等方面，按照Nei氏公式(1974)对各种数据进行分析计算，计算完成后，系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据，并将其导出为Excel文件，方便用户进行保存使用，需要的朋友赶快下载试试吧！

软件功能

　　定义矩阵：定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

　　输入数据：按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

　　读入数据：将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统，系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵，并将全部数据读入。

　　追加数据：在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据，主要用于计算遗传距离。

　　读入遗传距离：将保存到磁盘上的遗传距离数据读入,可直接用于聚类计算。

　　数据正规化：将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

　　计算杂合度：按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的杂合度。

　　计算多态性：按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的多态信息含量。

　　计算欧氏距离：在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注：如未在“定义矩阵”中定义分类数(等位基因数)，则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

　　计算遗传距离：在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Nei氏公式(1983)计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

　　进行聚类计算：在已计算或读入遗传距离后，可用此命令按P.H.A.Sneath等(1973)的类平均聚类法(UPGMA法，又称非加权算术平均数成对聚类法)进行系统聚类。聚类结果说明：第1列No为序列号，代表是第几次聚类；第2列D为距离系数；第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种，第5列Cluster为聚类后的新名称，第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

　　查看原始数据：将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

　　查看遗传距离：将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

　　查看聚类图：按照聚类后的结果自动画出聚类图。

　　保存聚类图：将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能!

　　保存矩阵：将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据，则保存原始数据；若为经过正规化处理过的数据，则保存经过处理的数据；若为杂合度，则保存杂合度;......;若为聚类结果，则保存聚类结果。未注册用户无此功能!

　　数据导出：系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据，并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能!

安装方法

　　1、下载解压文件，找到JLFX.EXE双击安装

　　2、进入安装界面，点击下一步进行安装

　　3、选择安装目录D:tools桌面pc0359，用户也可以自行更改其他安装位置

　　4、创建菜单文件夹聚类分析，可以帮助用户快速找到软件所在位置

　　5、创建桌面快捷方式，可以在桌面快速打开软件，点击是即可

　　6、安装预览，可以查看所有安装信息。点击上一步可以修改

　　7、正在安装，请稍后

使用方法

　　1、安装完成点击桌面上的软件打开，界面如图所示

　　2、点击矩阵大小，可以在这里控制数据的矩阵，定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

　　3、输入数据，将您的分析数据文件导入软件中进行分析，按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

　　4、数据正规化，可以将数据自动排版，将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

　　5、计算命令，您可以通过鼠标点击不同的计算项目进行数据分析，具有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、进行聚类计算

　　6、数据查看及保存命令、查看原始数据、查看遗传距离、保存聚类图、保存矩阵、数据导出

运行环境

　　1、硬件环境:

　　硬件名称 最低配置 建议配置

　　1).CPU中央处理器 586 奔腾ＰⅡ以上或兼容芯片

　　2).内存 　 32M 64M以上

　　3).硬盘自由空间 1M 10M以上

　　4).显示器 VGA真彩 SUPER VGA或液晶显示

　　2、软件环境:

　　操作系统: Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp

　　并安装有Excel97及以上版本的办公软件，否则数据无法导出为Excel格式的文件。

　　3、推荐使用：Win2000或Xp操作系统+Office2000。本软件在win98+win2000上测试通过，如运行不正常，请与作者联系。