Mascot daemon(蛋白质鉴定软件)

　　Mascot daemon(蛋白质鉴定软件)是一款专业的化学实验和生物学实验的软件，它能很好的协助您进行实验后的数据分析，帮助能对数据中是否含有蛋白质进行鉴定，您只要将您得出的数据输入到这款软件中，软件通过对质谱数据，利用肽段序列数据检索方式来鉴定样板中蛋白质的组成以及翻译然后标注，针对蛋白质或核酸序列号数据库的检索进行高强度的计算，快速且准确的分析结果，需要的用户欢迎进入河东下载。

软件功能

　　通过一个整合的软件包，支持目前主流的三种检索算法

　　通过特有的基于随机匹配概率的打分方法，支持标准统计显著性检验分析

　　针对大数据集检索的特点，整合FDR阈值选项及Percolator大规模数据检索质量控制算法，大大提高大规模数据检索的结果质量

　　可检索各种类型数据库，包括序列库和谱图库；智能、自动化的数据库管理模块, 灵活的私人数据库建立方式

　　可以自动建立检索目录，自动扫描数据库目录中已有的库文件识别其格式，无需指定酶的特异性，对于特异性的化学修饰或翻译后修饰的鉴定都非常灵活

　　支持几乎所有常用的质谱仪输出的数据格式。通过高效率的代码可满足从单线程到多线程系统或集群的高通量计算需求

　　支持所有的Web浏览器，给出概述性和详细的结果报告，可自定义蛋白检索报告形式，并且配以详尽的在线帮助文档帮助用户理解分析结果

　　已有数千个学术及商业用户，被Frost & Sullivan形容为“质谱数据检索的黄金标准”

软件特色

　　批量提交搜库任务：可以同时递交一系列的搜库文件进行同时、队列或者定时的搜库

　　时监控任务进程：当任务传递以后，能够实时对搜库进度进行监控

　　灵活的队列任务：能够对同一质谱文件进行多参数的多轮队列搜库

　　可以通过命令行直接向Mascot Server递交任务，避开IIS构架上运行Mascot对上传文件大小4GB的限制

　　和Distiller联用可以批量进行所有类型的质谱原始文件搜库

　　加入导出和导入工作任务数据库的功能，不需担心在软件升级后，原有的工作任务列表丢失

　　在Windows操作系统中，Mascot提供了一个批量上传搜库任务的桌面客户端，能够保存各类搜库参数和工作任务

安装方法

　　1、在河东下载压缩软件，解压文件，找到“daemon_setup.exe”双击进入

　　2、如图所示，进入软件安装界面，点击“Next”按钮

　　3、提示您阅读安装协议，选择“I accept the agreement”点击“Next”按钮

　　4、如图所示，提示您选择安装路径，为了节约您的电脑资源，推荐您选择D盘安装，选择D盘点击“Next”按钮

　　5、如图所示，提示您创建快捷方式，勾选“Create a desktop icon”点击“Next”按钮

　　6、如图所示，软件安装完毕，点击“Finish”按钮，完成安装

使用方法

　　1、在桌面找到软件，双击打开

　　2、如图所示，进入设置界面

　　3、根据提示，在Intranet界面分别填写您的服务器名称、access type（访问类型）、proxy server（代理服务器）、选择 http protocol（入网协议）

　　4、如图所示，在data import filters（数据导入过滤器）选择导入过滤器缓存的文件的根文件夹、保存路径、AB SCUEX MS 数据转换器路径、ProteoWizard ms装换路径

　　5、如图所示，在开放数据库连接界面，选择Engine（引擎）、Driver（驱动程序）Path（路径）

　　6、如图所示，在Timer settings（定时器）界面，设置timer tick interval（定时器间隔）、delay after opening empty dataset（延迟开放后空的数据集）、file size wust be constant for at least（文件大小必须至少保持不变）等

　　7、如图所示，在authentication（身份验证）界面，设置web server authentication（web服务器身份验证）、proxy server authentication（代理服务器认证）、mascot security（mascot 的安全）

　　8、以上内容设置完毕，点击“Save”按钮，您界可以进行操作了