primer premier 5下载-primer premier(引物设计软件) 5.0 官方版

　　primer premier 5是一款综合性能非常丰富的引物设计工具，主要用户基因分析方面额研究，在DNA中，需要分析不同类型的链接限制酶、氨基酸在分解过程中产生的变化，可以通过这款软件完成模拟分析流程，该软件就是用来进行引物设计的，可以利用鼠标简单的拖动出扩展的DNA链，并且可以根据用户改变的状态同步显示可能会改变的二聚体、异二聚体、发夹结构等，让软件帮助您自动完成搜索引物流程，分析完毕以后可以方便的生成数据报告，为您的基因研究提供可以参考的标准数据，需要的朋友可以下载试试！

软件功能

　　引物设计用于标准PCR测定

　　Primer Premier是设计和分析PCR引物的最全面的软件。

　　Primer Premier的搜索算法使用最接近的热力学算法找到具有最准确的熔解温度的最佳PCR，多重和SNP基因分型引物。根据次序结构，二聚体，发夹，同源性和物理性质对引物进行筛选，然后按排序顺序报告序列的最佳序列。配有方便的计算器，您可以轻松地操作序列并分析底漆设计的结果。

　　从NCBI加载感兴趣的基因，选择一个搜索范围，坐下来让Primer Premier为您挑选最好的引物。

　　SNP基因分型测定的引物设计

　　使用Primer Premier，您可以从dbSNP加载序列，并将引物设计为选择的SNP侧翼。数百个未发表的SNP也可以通过将其指定为标准GenBank / dbSNP文件中的变体特征来加载。在指定SNP后，可以设计引物以扩增它们以使用基于探针的化学物质进行检测。

　　多重检测

　　对于多重实验，Primer Premier允许您以批处理

　　模式启动引物搜索，然后检查所设计的引物的交叉反应性，从而减少错误引发。

　　自动同源性和模板结构避免

　　Primer Premier自动解释BLAST搜索结果，并避免这些区域设计与数据库具有显着交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中突出显示，并且在引物搜索期间避免。

　　由于延伸温度下存在模板结构，引物延伸可能受到阻碍。为了避免所有这样的区域，模板可能在其自身上折叠，程序利用专有算法在您指定的折叠温度下检查模板中可能的二级结构。涉及形成二级结构的区域在序列视图中加下划线，并且在设计引物时避免。

　　避免同源区域使寡聚物高度特异性，并避免模板结构提高设计引物的效率。

　　手动入门搜索

　　Primer Premier为用户提供对底漆设计的完全控制。使用手动引物搜索选项，用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感觉或反义引物。Primer Premier立即计算并显示新引物的性质。最后由用户选择的引物随后显示在主窗口的序列视图中。

　　编辑模板序列

　　模板序列是可编辑的，可以由用户更改。基座可以使用标准的剪切/复制/粘贴功能进行修改。可以使用“删除”按钮删除不需要的序列区域。用户可以对序列进行注释或注释，并保存以供将来参考。

软件特色

　　新改进的搜索算法

　　自动序列检索

　　自动同源性和模板结构避免

　　评估预先设计的底漆

　　手动入门搜索

　　编辑模板序列

　　序列视图

　　生成报告

　　本地和桌面BLAST选项

　　计算器

　　数据和数据库管理

安装方法

　　1、下载解压文件，找到“PP600Installer.exe”双击安装

　　2、阅读软件的使用协议，点击第一个接受继续安装

　　3、选择软件的安装位置，默认C:Program Files (x86)Primer Premier 6.0

　　4、正在安装中，请稍后

　　5、显示已经安装成功了，点击done结束安装

主要优势

　　Primer Premier现在提供了一个新的改进的图形用户界面，使PCR引物设计既直观又易于使用。

　　引物搜索算法得到很大改进，以避免同源性和模板结构，使得Primer Premier设计的引物具有高度的特异性和高效性。可以使用验证BLAST确定引物特异性。

　　Primer Premier现在可以帮助设计10-plex多重测定。

　　Primer Premier现在可以完全控制底漆设计和设计参数。使用手册引物搜索选项，您可以单击模板序列上的任何核苷酸，以在您选择的位置获取引物。Primer Premier设计了一个底部，其3'端位于该核苷酸，并即时分析其属性，帮助您根据实验的需要决定最佳设计。引导剂的长度也可以根据您的方便而增加/减少。

　　现在可以进行序列编辑。序列的不需要的区域可以被去除或操纵。

　　Primer Premier可以设置替代扩增子之间的最小距离，这样可以覆盖序列的不同区域，并以最佳可能的设计为零。

　　现在可以以所选择的模板序列的任何方向分析预先设计或公布的引物。该程序指定引物是否与正向，反向，互补或反向互补取向中的序列同源。即使使用错配，也可以相对于模板序列分析预先设计的引物。Primer Premier编辑了所有可能的引物结合位点的列表。

　　现在可以分析预先设计的引物或公开的引物。Primer Premier甚至可以设计一个兼容的引物，给出正向或反向引物。

　　现在可以看到序列视图，它可以容易地将设计的引物相对于序列可视化。您可以从视图中复制粘贴序列，并在程序中进行分析。

　　Primer Premier增强了序列导入限制。您可以一次使用5MB的序列，总共可以加载15MB的序列。