dnaman8(多功能综合序列分析)免序列号

　　dnaman软件是一款可以帮助您过得研究生物实验数据的应用程序，当您在分析生物序列的时候，使用电脑软件的强大分析技术以及计算能力，可以让您在进行复杂运算以及模拟DNA运行状态的过程中拥有一个可以完美打搭载您数据计算的平台，本软件支持的分析类型非常丰富，包括蛋白质分析、分子研究、引物分析、序列对比研究等模块，让您在研究生物实验数据的时候更加方便；dnaman8(多功能综合序列分析)内置图形分析，您可以将自己的实验数据发布到软件上，利用自动统计以及图表功能获得详细的数据走势分析，为后期的模拟实验提供重要的参考数据。

软件功能

　　两个引物互补

　　您可以使用DNAMAN检查两个寡核苷酸序列的互补性。 要执行此功能，第二个引物应通过选择引物|载入DNAMAN存储器 两个Primer互补命令。

　　DNAMAN搜索两个引物之间的互补序列。 结果表明两个引物之间的连续和不连续的互补序列。

　　PCR引物设计

　　您可以使用DNAMAN选择满足您扩增模板DNA要求的PCR引物。 设计了许多参数来筛选PCR引物，例如PCR产物大小，引物长度，Tm，GC组成和盐浓度的范围。 其他参数用于排除“低质量”引物。

　　导入和导出记录

　　从文本文件导入记录

　　从文本文件导入寡核苷酸序列是将大量oligo记录添加到数据库的便捷工具。

　　DNAMAN将记录的信息列入七个字段：名称，来源，备注，长度，GC含量，熔解温度和序列。如果数据库中有大量记录，则可以使用前四个字段作为排序键，以便在“记录列表”框中选择性地显示记录。

　　导向不匹配

　　定向错配可以通过在突变附近的位点引入单次或双重错配来创建或去除当前DNA序列或其变体上的限制性位点。 使用此功能，您可以创建或破坏限制性位点，以区分野生型等位基因与常见突变体等位基因。

软件特色

　　扫描序列的相似性

　　DNAMAN扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列，则默认序列必须是DNA序列。如果默认数据库包含蛋白质序列，则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性。您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。

　　编辑记录信息

　　有关特定记录的信息可以编辑。在序列列表框中，所有记录按字母顺序或记录顺序列出。每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此，您可以为不同的记录使用相同的名称。

　　DNA和蛋白质数据库

　　DNAMAN软件的数据库功能，允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。

　　数据库管理

　　选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。

　　错配分析

　　错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认。此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3‘末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要，所以更多的权重被赋予3‘末端。为了提高PCR引物的特异性，应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。

安装方法

　　1、首先下载DNAMAN8_Reg_setup.exe软件，点击运行或者打开，出现安装的界面

　　2、在下方可以选择安装地址，这里默认是DNAMAN8_Reg_setup.exe，可以单击浏览修改其他路径

　　3、出现安装的过程，安装结束以后不会出现提示，直接在桌面找到软件的图标就可以启动

　　4、这个就是软件的主要程序，可以双击DNAMAN 8运行软件

使用方法

　　DNAMAN系统配置设置

　　选择信息|设置命令设置系统配置分析。

　　有四页来设置目录、DNA分析、蛋白质分析等的配置参数。

　　文件夹设置

　　文件夹设置在DNAMAN是重要的。如果文件夹没有正确设置，程序可能无法正常运行。有六个文件夹需要DNAMAN：

　　1。DNAMAN系统文件夹。所有的分析系统文件存储在该文件夹中。DNAMAN离不开这个目录。

　　2。数据库文件夹。这是您可以找到所有数据库的文件夹。

　　三.多重对齐文件夹。您可以使用此文件夹存储多个对齐数据。

　　4。一致性数据文件夹。DNAMAN保持一致性数据文件在该文件夹中。

　　5。默认文件夹。DNAMAN的开始总是在这个文件夹。

　　DNA分析设置

　　使用预设文件基因DNA序列分析。此页中有六个文件名。

　　1。核苷酸属性文件。DNAMAN使用这个文件来显示核苷酸的性质。

　　2。酶的文件。这是当前制约数据文件用于限制性分析分析。

　　三.注释文件。这个文件保存所有序列的注释被DNAMAN。强烈建议不要更改此文件。

　　4。甲基化文件。DNAMAN使用也这个文件限制性分析，当大坝和/或DCM甲基化参与。

　　5。搜索列表文件。此文件包含用于序列搜索的一致性序列信息。

　　6。爆破模板文件。DNAMAN使用这个文件作为模板文件产生爆炸。

　　您可以修改这些文件名。但是，必须确保文件存在，并且包含序列分析的正确信息。

　　蛋白质分析设置

　　DNAMAN采用也为蛋白质序列分析的一些预先设定的文件。本页有五个参数。

　　1。遗传代码表文件。这个文件包含所有的遗传表。DNAMAN使用这个文件来翻译分析发现不同的基因表。

　　2。现行遗传密码表。这是用于翻译分析DNAMAN当前遗传表。

　　三.氨基酸属性文件。DNAMAN使用这个文件来显示氨基酸性质。

　　4。氨基酸类似文件。这个文件包含氨基酸相似矩阵。DNAMAN使用这个矩阵定义两蛋白序列比对氨基酸之间的相似性。

　　通过单击生成相似矩阵按钮，可以生成一个新的氨基酸相似度文件。

　　杂项设置

　　本页包含几个重要的设置分析。

　　1。退出前保存频道信息。你可以在当前会话终止DNAMAN保存现有的信道信息。当这个选项打开，DNAMAN将保留所有信道信息对DNAMAN下次会议。

　　2。mased字体。这是一个mased文档的默认字体。

　　三.打印显示页码。如果您想在打印文档时显示页码，请选中此选项。

　　4。显示文件名路径。如果您希望在打印文档时显示文件信息，请选中此选项。

　　酶的文件转换

　　你可以转换酶从GCG格式DNAMAN格式文件。这是特别有用当你想导入垫底文件的新英格兰生物实验室的分析。你可以下载文件从互联网垫底用GCG格式和使用这一功能，进口分析。

　　数据信息和设置

　　数据信息采用DNAMAN，如限制酶数据库和氨基酸性质，可以访问和修改用户。当你成为DNAMAN专家，你可以利用这个软件进行一些修改。

　　互补的DNA

　　DNAMAN寻找寡核苷酸和当前序列的两股之间的互补序列。如果连续的配对基数等于或大于10 bp，则在文本窗口中显示两个最长的互补序列。

使用说明

　　甲基化酶

　　有两个位点特异性的DNA甲基化酶，大坝和DCM，许多大肠杆菌菌株。参考文献：麦克利兰。和罗伊·尼尔森。1988。基因74:291。选择信息|甲基化命令显示表的限制性酶切位点以大写字母表示。所涉及的酶用于筛选甲基化信息在限制性分析（见第X.1）

　　遗传密码表

　　有七个遗传密码表中使用DNAMAN。选择信息|遗传代码命令显示通用的遗传密码及其变化。不要使用此命令修改遗传代码信息。你必须从蛋白质|选择的编码信息的修改遗传密码指令访问。

　　氨基酸性质表

　　氨基酸性质信息被用来计算蛋白质pi和电荷，也用于绘制疏水/亲水性剖面图。选择信息|氨基酸性质命令显示的信息。

　　单序列数据库检索

　　您可以在DNA数据库中搜索核苷酸序列，也可以在DNA或蛋白质数据库中搜索氨基酸序列。

　　核苷酸序列

　　选择打开一个对话框的核苷酸序列数据库搜索命令|。在DNA默认数据库中的所有序列记录的两个链上搜索DNA序列。搜索的格式与当前序列中的搜索相同